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有人会说，文明一旦建立，不可能发生萎缩。这是不正确的。马奥利族曾经是一个驰骋太平洋的航海民族，但是在他们定居新西兰以后，就逐渐脱离了航海，以至后来把所有的航海技术都忘记了，历史学家和民族学家曾把这种现象用“第二次野蛮”来形容。这种文化倒退的种族在世界上还有许多，有的甚至退回到原始状态里去。第二次世界大战的时候，希特勒德国曾有过一个“马达加斯加计划”，即剥夺所有犹太人的一切生产、生活资料，然后流放到马达加斯加岛，任他们自生自灭。万幸的是，这个计划随着法西斯德国的失败而流产，否则的话，犹太人很可能会发生一次文明的大倒退。
我们人类在大洪水过后就曾经发生过文明萎缩的倒退现象。从高山上走下来的落后的牧羊人，很快就意识到知识对他们有多么重要，他们在洪水退去的废墟中仔细寻找上一次文明留下的各种知识。在这些知识中，有一些是他们可以理解的，但更多的却是他们无法接受的。理解的被保留了下来，更多不理解的，除一部分被保留下来以外，绝大部分被再一次毁灭了。
如果我们以上的推测是正确的话，那么就应该在上古神话或其他方面存在相关的证据。幸运的是，我们好像确实发现了这些证据。
在我们研究世界神话的时候，发现了这样一个奇怪的现象：许多地区、许多民族的神话里都有关于知识和一棵树的故事，而在这类故事当中，必然会出现一种动物，而这种动物在神话中的寓意也必然与大洪水有关，例如：
中国最原始的文化可能要属《周易》，它是中国上古文化的总纲。相传《周易》的一个重要组成部分就是河图和洛书，民间传说，伏羲时有一龙马从黄河而出，龙马背上驮着一幅图，这就是“河图”；又有神龟自洛水出，背上有一部书，此为“洛书”。所以后人说：“河出图，洛出书，圣人则之。”这里面《河图》。《洛书》（即《周易》）无疑是知识的代表，龙马和神龟与知识的出现有相当大的关系。
《圣经》中有亚当和夏娃偷食善恶果树上的“知善恶”果，“知善恶”本身是一种是非标准，它应该属于知识、智慧的范畴之内，而亚当和夏娃之所以这样做，是受到了一条蛇恶意的诱惑。这则故事中有知识、树、蛇三样东西。
北欧的古老传说中有圣树，人如果吃了这棵树上的果实，就能获得超越自然的知识和聪明，而这棵树是由一条龙在看护着。这则传说里有知识、树、龙三样东西。
在古希腊的神话里有“宇宙树”的传说，一条名叫拉敦的蛇守护着它。大神赫拉克列斯想尽办法，杀死了蛇，得到了写有魔法知识的书。这则传说同样有知识、树、蛇三样东西。
在爱尔兰的传说里，有关于吃了知识树上的果实而变成千里眼的特马斯的故事。故事中同样有知识、树两样东西。
据印度的佛经记载，佛陀释伽牟尼悟道时就是在一棵菩提树下。另外，印度的维休努神传统上也画在一棵树下，据传说，这棵树被称为“宇宙之树”，树上的果实，象征着关于过去、未来的最高知识。
此外，在古埃及、阿卡台、巴比伦、日本、斯拉夫人地区。墨西哥等等民族的神话传说当中，几乎都有关于人类知识与树。与水的神话和传说。
如果我们将上述一类传说归纳分析一下，我们会意外发现，所有的故事都在讲述两种东西：知识与大洪水。中国的河图、洛书本身就出自于黄河、洛河，这不用多说了，它们一律与水有关。其他一些神话中虽然没有明确说到水，但仔细研究，实际上每一项都与水有关，关键就在于神话故事中龙、龙马、蛇这些动物身上。
大家知道，蛇在神话中一般表示水，比如说，在埃及的神话中有一位大神名字叫努，她是水神，长着蛇头人身。龙代表水就更不用说了，《楚辞·天问》云：“应龙何画，河海何历？”《山海经》曰：“禹治水，有应龙以尾画地，即水泉流通，禹因而治之。”后来民间求雨一般都是起土龙、扎草龙，以龙象水。实际上，龙和蛇在古代神话中的寓意基本差不多，中国民间就有将蛇看成似“小龙”的说法。
按照这样一个理解，上述神话中在谈到知识与蛇、龙的关系时，基本上是想告诉后人：人类最初的知识来自于洪水。所以我们只能认为，这些神话的本意是这样的：在毁灭人类的大洪水过后，幸存下来的人们在洪水的废墟中找到了以前人类留下的文明成果。
事实上，在人类目前的神话和传说中，就有一些大洪水以前人们有意留下某种知识的记载，只是在此以前很少有人留心过，我们举几个例子：
根据古代埃及历史学家奈敦的著作，在大灾变到来之前，传说里的先哲特特卡，决定把自己的重要知识保留下来，因此之故，特特卡作为赐予人类文明的知识、智慧之神，在埃及诸神的万神殿中受到祭祀。
阿拉伯古代历史学家马斯乌蒂，根据当时的资料作了如下记载：“一位洪水之前还活着的帝王斯利德，命令祭司们造两座大金字塔，将他们得到的知识和各种艺术以及科学成果藏在里面。这是为了使这些成果躲过灾难，让后代的人们知道，这位帝王还把星辰的位置及其周期以及其他知识记载下来。”
同样的记载也发现于阿布·巴尔库希的著作中，大洪水以前，先哲们已经预见到大灾难将至，“在下埃及用石头建造了许多金字塔，作为灾难开始时的避难所。这些金字塔中的两座，长。宽、高均为40罗科奇（大约200米），比其他金字塔都出色。这两座金字塔都是用磨过的、很大的大理石修造的，石块砌得严丝合缝，好像根本没有接缝。在这些金字塔内部，写有贤哲们打算保存的、令人吃惊的各种知识。”
巴比伦的历史学家、宗教祭司拜罗斯（公元前3世纪），也曾谈到大洪水前的人们曾经保留知识的情况。根据记载，帝王科西斯罗斯在知道洪水降临不可避免时，曾命令：“写一部关于一切事情的开始、经过和结束的历史书，将其埋到太阳城希帕尔中。”另一位古代历史学家、博物学家约瑟夫·弗拉比也记载说：“他们想，他们的发明成果不要在广泛被人知道以前就被遗忘，于是他们建了一根砖柱和一根石柱，是为了即使前者被洪水冲倒，后者依然安然无恙地保存下来，使柱子上写的知识广泛被人知道。”据说，这根石柱在公元前1世纪依然存在，就在太阳城的旧址——希帕尔。
通过以上这些记载，我们基本上可以断定，在人类文字发明以前，地球上生活的人类中间，确实曾有过一次伟大的文明，当时的文明程度之高，已经远远超出了我们的想象之外，巨大的金字塔、越王剑、铬盐氧化处理法、神秘的《周易》、令人意想不到的中医、奇怪的玛雅历算、突如其来的机器人……都在告诉着我们这样一个事实。
那么，大洪水以前的文明究竟是个什么样子？它的基本原则是什么呢？它究竟达到了一个什么样的程度呢？
第四节 中介文明
“中介文明”的观点，是我们立足于中国古代文明成果，为解释包括印度在内的整个东方文明体系，而提出来的本书第四个重要假设，它是相对于现代“物质文明”而言的。当然，这样的划分仅有方法上的意义，因为如果不这样划分，我们就无法分析“中介文明”特点。因此，作者申明，在此我们没有有意批评任何一种文明的企图，所有的分析都是善意的，目的是为了更好地让人了解已经丢失的一种文明存在的价值。
客观地说，对于人类留存下来的远古文明的意义，人类对它们的研究是越来越少，当现代科学产生之初，为了树立一种权威，我们基本上是把远古文明当成迷信来对待的；当现代科学产生以后，由于我们过分局限于自己发明的方法和理论，并以此来作为衡量一切的尺度，因此在有意无意之间，排斥了远古文明；从80年代开始，世界上形成了一股文化的回归热，从不同的角度关注远古文明，但是由于认识、方法上始终没有突破，使这股回归热到目前已经彻底失去了目标。
如果我们可以再往前推论，实际上人类从一开始就没有很好认识远古文明。从目前留下的古代文献中，我们可以明确地感觉到，从有文字记载历史以来，人类在进入这种文明的时候就显得十分盲目，以中国为例，《周易》乃远古文明的总纲，但中国人在一开始解释《周易》的时候就很混乱，一部《周易集解》荟萃了历史上一些有创见性的认识，但分歧之大却是有目共睹的，更重要的是，这些注释让后人读不懂，尤其是对《易》理部分，至今没有明确、统一的认识。后来的学者们，由于对《易》理认识不够清楚，因此无论是从哲学、社会学、宗教、民族学、文学等方面入手，只能是越解释距离《周易》的本质越远。到今天，实际上我们对《周易》的理解与古代并没有本质上的差异，古代人不懂，我们照样不懂。
为什么会如此呢？原因就在于我们现有的文明结构是建立在什么论点的基础之上，也就是说，在于我们以什么样的目光看待眼前的世界。
追求对自然的总体认识，是人类根深蒂固的潜意识，积6000年的文明成果，我们发展起一套对自然认识的方法和理论，经验告诉我们，这套方法和理论是行之有效的。它简单明了，直截了当地针对我们一切物质需要。6000年来，我们在这样一套方法和理论的指导下，取得了意想不到的成就。但是，如果我们提一个问题：我们今天对世界的认识方法和理论是唯一正确的吗？看来定论未必容易下。从哲学的角度看，我们今天认识世界的方法仅仅是无数方法当仔的一种而已，也就是说，我们仅仅从一个角度、一个侧面认识了世界。
那么，我们今天是如何来看待眼前的世界呢？尽管哲学上的分歧有许多，但有一点是基本可以肯定的，我们是站在“世界是物质的”这样一个角度来看待世界的，这就是我们对世界的基本看法。由于有了这样一个看法，我们积6000多年的知识积累，建立起一套文明的结构，例如，目前世界上一共约有2400门学科，但这些都是以物理学为基础的。甚至，在人文科学里也要遵守物理学的法则，比如，现代哲学观点的提出就是以物理学取得的成就为基础的。当我们从“世界是物质的”的观点去看待自然的时候，我们会自然引出许多相关的观点，比如，“人定胜天”的观点等等。建立在这种观点之上的文明，我们把它称为“物质文明”。
那么，除了“物质文明”的方法，是不是还存在其他认识世界的方法和角度呢？回答是肯定的。但这种方法究竟在哪里呢？我们认为，这种方法本来早已存在于人类的文明之中，只是我们没有认识到而已，那就是远古文明的方法，这要从远古文明认识世界的角度谈起。
为了方便起见，也为了对比地进入我们将要讨论的问题，我们从两种文明中各自取出一门学科进行对比，从“物质文明”中我们选择了西医学，从东方的远古文明中我们选择了中医学。
西医学是建立在人体解剖学基�